反恐特大队的钟原，在一次行动中，杀死了猛犸巨象的二当家，惹来了一场报复。在营救赵欣的过程中，钟原被注入了一种被感染的病毒而备受煎熬。DK生化公司总裁江寒，邀请赵欣和他的初恋情人，生化专业的高年级学生和他的爸爸一起参与了公司的“有益菌”实验。按照 T国的要求，反恐怖指挥部派出了“专家”，混进了公司。赵欣在失去儿子后，自告奋勇地“退出现役”，投身虎穴。一连串的恐怖袭击，让《新时代》的故事慢慢地浮现出来。饱受病魔之苦的钟原带着乔大鹏和麦萌萌等特种作战部队，在妻子赵欣和“失踪”的陆豪的帮助下，一举摧毁了恐怖分子的连环套计划和生物攻击，揭露了江寒利用“有益菌”作为载体的病毒真正真相。