忍者は、存在しない。…と、我々は思っている。 　　仮に忍者が存在したところで、忍者はその姿を我々に晒すことはない。 　　だからこそ、忍者は『表向きには』存在しないのだ。 　　主人公、櫻羽一時は、我々と同じく忍者は存在しないと思っている、普通の男子。 　　彼には普通の、幸せで輝かしい日々が約束されている…はずだった。 　　ある日、一時は命を狙われ、それが甲賀忍者の仕業であると聞かされる。